药师法门的功德利益：
一：药师法门以读诵《药师琉璃光如来本愿功德经》，念药师灌顶真言（药师咒），念南无药师琉璃光如来名号为根本，法门殊胜。
二：药师法门是现生就能得福慧的法门。药师佛行菩萨道时发十二大愿，令我们发挥财富，所求皆得。
三：药师法门是最适合相貌不好的人修。有人体身下劣诸根不具。丑陋顽愚，盲聋喑哑，挛躄背偻，白癞癫狂，种种病 苦。念南无药师琉璃光如来名号，来生就会长得非常美丽。
四：药师法门是最适合贫穷的人修。念南无药师琉璃光如来名号，很快就能得到财富。
五：药师法门是最适合病苦的人修。众人有病，逼切无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦。念南无药师琉璃光如来名字，一经其耳，众病悉得除身心安乐，家属资具悉皆丰足。乃至证得无上菩提。
六：药师法门是最适合诸事不顺的人修。众生心中随所乐求，一切皆遂。求长寿得长寿。求富饶得富饶。求官位得官位。求男女得男女 。
七：药师法门是最适合一心求生极乐世界，而没有把握的人修。有人愿生西方极乐世界无量寿佛所。听闻正法，而未定者。修学药师法门，临命终时有八菩萨。乘神通来示其道路，即于彼界种种杂色众宝华中自然化生。易得弥陀本愿海，唯修药师本愿海。
八：药师法门是最适合持戒不严的人修。有人学习如来正法。而破戒律。有虽不破戒律而破轨则。有于戒律轨则虽得不坏，听到药师琉璃光如来名号。便舍恶行修诸善法。不堕恶趣。设有不能舍诸恶行，修行善法。堕恶趣者。由于如来本愿威力。令其现前暂闻名号。从彼命终还生人趣。得正见精进善调意乐。
九：药师法门是最适合灾难重重的人修。灾难起时，所谓人众疾疫难，外国侵逼难，国家政变难，星宿变怪难，日月薄蚀难，非时风雨难，过时不雨难。如果能供养药师琉璃光如来，众难解脱。
十：修药师法门，不会九横死，不会中邪，因为有药叉菩萨保护。
十一：若是女人讨厌女人身，听到世尊药师如来名号，至心称念，于后不复更受女身。
十二： 修药师法门，聪明智慧，勇健威猛，如大力士，速成佛道。
是故，药师法门为末法必修法门。
