唯识学是由存在论和认识论两大部分组成。所谓唯识义者，就是阐述万法唯识、唯识无境的存在观；所谓法相义者，就是诠释万法性相的真实原理，也就是唯识学的认识论。在理论上，存在论与认识论是互为前提的，没有存在论的认识论是无效的，反之亦然。唯识学认为，唯识学是内明的“无上无容”的法门，是释尊一生教法的极谈。唯识学的存在论和认识论更能体现一种独特的优越性，那就是它所阐释的道理十分圆满，令人生起净信，并且具有可实践性。

    在唯识学看来，一切世间学没有了达真实，所以就不可能有真实的存在论；同时一切世间学既然没有对真实的认识，所以也自然不会有真实的认识论。世间学的这种虚妄性，是由遍计所执性造成。所谓遍计所执性者，就是指主体心识于一切法周遍计度，执取为实，安立名言。这种认知功能是于情而生的，是情有理无的。用现代哲学语言来讲，遍计所执性是一种知性化思维，是形而上学的思维方法。它是能取与所取的分离，也就是主体与客体的二元化。唯识学认为，只有以真实的存在为所观境，才能形成真实的认识。唯识学在确定自己的理论与实践的取向时，是先破遣外执，成立唯识义。所谓唯识者，就是讲识外无境，唯有内识。即一切法离识无体，一切法唯识所现。唯识学认为我人所观一切法皆不离识，是识所转变，并无有识外之物可被认识。唯识者，就是唯能无所。“唯识无境”之命题确定了唯识学的所观境。在唯识无境这个存在论的前提下，对识的性相进行如实观就是法相学了。法相学是诠释五法三自性为内容的。所谓五法者，即名、相、分别、正智、真如。所谓三自性者，即遍计所执自性、依他起自性、圆成实自性。

    法相学顾名思义就是诸法实相学。在法相学看来，一切法的真实相是真如，这个真如是无为法，是不生不灭的法性理体，由正智(菩提)所觉知。世间学说，是依虚妄分别之识来缘名相，并妄执为实有。法相学认为，只要破遣了名相分别，就可契入正智与真如之界。名相分别为遍计所执性所摄，正智与真如为依他起性和圆成实性所摄。法相学具有极为深刻的认识论内涵，它在阐释转识成智的过程中，对是非两种不同的认识进行了细致的分析和解释。转识成智是内明的目的，在转依过程中，有转舍和转得两个环节。遍计所执性的思维方式就是要转舍的，圆成实性的心性真如就是要转得的。三自性中，依他起性是转依的轴心。所谓依他起性者，我认为是缘起能相识，它有净依他性和染依他性。遍计所执是于依他起性法上，起有情见之执，这就是染依他性。圆成实性是于依他起性而呈现不变理体，所以可称为净依他起性。圆成实性就是唯识真如。法相学对诸法的分析是为唯识观行提供真实观法，所以说法相学是真理学，是原理学；唯识学则是存在学和实证学。唯识学的内容就是八识和二无我。所谓八识，就是一眼识、二耳识、三鼻识、四舌识、五身识、六意识、七末那识、八阿赖耶识。所谓二无我，即一人无我、二法无我。八识就是有情之一切。八识有三能变之功能，一异熟变、二思量变、三了别境识变，一切法相皆三能变之现行果。唯识学认为，凡夫于情起执，对能变与所变之法起人我执和法我执，由二执故生二障。二障者，一是烦恼障，二是所知障。因有二障，故有二种生死。二种生死者，一是分断生死，二是变异生死。唯识学认为，只要用我法二空智，就可以破除人法二执，执除障断，二死自然解脱，由此即可证得二胜果。二胜果者，一是菩提果，二是涅槃果。唯识学就是究竟解脱之学。二无我者，可显圆成实性，因为圆成实性就是二空(无我)所显之真如。真如法性是不生不灭的理体，唯妙智所证，它是绝四句、灭百非的，是心行处灭、言语道断的，唯识学称为是废诠谈旨谛。

基于这样的存在论和认识论，法相唯识学当然是与一切世间学说不共的。从唯识法相的原理出发，可以判定世间学说的三大错误，一是识外的存在论，二是二元性的认识关系，三是经验论和唯理论的逻辑方法。基于这三种观点，是永远无法认识到真实的。唯识学的存在论和认识论并非是从凡夫心识推演出来的，而是受到先觉的启示，依圣言量而建立的。“唯识无境”是现量命题，它是无法用比量证成的。虽然唯识学在一些知识性问题上用了许多因明逻辑和中道辩证法，但是唯识学并不承认逻辑可以证明真如的存在性和实在性，因为因明与中道都只是言思范围的工具，只是一种对治方法，而真如——这种终极真实只有在妙觉果地方可了知。唯识学是因地法门，是从承诺价值入手，把对绝对真实的判断放到正觉时。我们必须承认，绝对真实对于我们凡夫来说，它只是一个目标和假设，并不是一个现量。内学的一贯方法，是以破妄来显真。绝四句，就是破世间句义(即种种判断)之虚妄性，在世间句义中并无真实存在，因为真如是亲证境界，并不是一个抽象概念范畴。对治世间学说的虚妄分别，最有效的方法就是缘起论。缘起论是否定论，是对自性实体的否定。有人把缘起论当成真理观，其实是一种误解。经论中有言缘起性空是诸法实相之句，仅是指言说之真如，并不是指离言法性真如，所以不可把言说真如当定理，否则内明就会落于四句之内。唯识学认为，世间学说都是于识外求法，所以终不得实在。基于一个外在求法的前提，而开演的二元性认识关系，就更无法与真实相契合了。二元性的认识关系的错误在于主体与客体的绝对分离，这样所谓的主体就永远无法成为认识的对象。因为在二元性的认识关系中，所认识的主体也是客体化的主体，并不是主体对主体自身的现量直观。自缘自，在二元性的认识形式中是不可理解的，然而唯识学正是这样的，唯识把二元性摒弃掉了，从阿赖耶识的维度把主体与客体统一了起来，并摄所归能，即在认识关系上讲唯识。《瑜伽师地论》说“相由想生”，相就是客体相分，想就是主体见分。境由能境，能由境能，主客一体。世间外学种种学说，无论宏观微观、物质精神、唯物唯心、辩证形而上、经验论理性论、可知论不可知论等等，从唯识学角度来看，不外乎是用世间现量和世间比量所立量果而已。而唯识学认为，世间现量并不是真实的现量，只是六识中刹那刹那的率尔心；世间的比量不过是逻辑规范，即归纳与演绎、分析与综合、玄想与类比等等方法和工具而已，这些方法和工具是认识不到绝对真理的。唯识学认为，这些都是遍计所执性，是虚妄分别有，并不是客观存在。当然就有情世间而言，世间的现比二量还是相对极成的，因为这正是有情世间这一族群共业所感之果，而并非是如实境界。《瑜伽师地论》讲四种真实，认为世间的真实有两种：一是世间极成真实，二是道理极成真实。世间极成真实就是世间现量境界，由共业所感，得成共许。道理极成真实就是世间比量境界，也由共业所感，得成共比量。然而唯识的真实是净智所行真实，是断除烦恼和所知障后所显的真实。这个真实就是心识的本性，也就是圆成实性，是正智所觉境界。